84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  40.45 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  42.53 
 
 		 306 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  41.56 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  40.39 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  39.55 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  40.52 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  39.41 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  36.63 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  39.55 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  40.26 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  41.1 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  33.66 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  41.37 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  41.67 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  41.67 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  35.81 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  35.97 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  35.81 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  38.56 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  38.56 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  38.03 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  37.13 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  39.48 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  39.48 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  39.29 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  36 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  34.63 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  38.78 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  37.93 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  27.15 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  47.15 
 
 		 128 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  44.23 
 
 		 609 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  44.23 
 
 		 609 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.9 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  32.34 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  27.6 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  28.16 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  33.77 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  35.04 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  32.61 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  26.9 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  25.16 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  23.59 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  23.33 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  25.94 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  28.12 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  34.43 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  34.43 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  34.43 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  34.43 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  26.12 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  25.43 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  24.45 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.77 
 
 		 421 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  27.86 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  31.94 
 
 		 493 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  35.16 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 345 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  35.96 
 
 		 182 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  31.21 
 
 		 450 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  27.05 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.02 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  35.09 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  30.58 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  34.65 
 
 		 440 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  32.97 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  34.65 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 454 aa  45.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 454 aa  45.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  25.16 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  32.35 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.6 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  25.14 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  33.06 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  27.56 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  24.64 
 
 		 403 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 262 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  27.87 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>