135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2767 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  100 
 
 		 520 aa  1080    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  46.77 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  47.46 
 
 		 207 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  40.17 
 
 		 171 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  41.38 
 
 		 182 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  41.38 
 
 		 182 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  45.83 
 
 		 249 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  44.79 
 
 		 247 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 200 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  41.38 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  41.38 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  41.38 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  42.71 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  42.71 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  42 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  42.86 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  41.76 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  41.05 
 
 		 145 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33.64 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  42.11 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  39.84 
 
 		 1291 aa  70.1  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  41.05 
 
 		 289 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  33.64 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  39.58 
 
 		 249 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  43.75 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  33.06 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  33.04 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  28.28 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  34.41 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  40.68 
 
 		 168 aa  57  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33472  predicted protein  32 
 
 		 170 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.403961  normal  0.102775 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.5 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  34.58 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 279 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.64 
 
 		 832 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  35.14 
 
 		 208 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.06 
 
 		 668 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  37.18 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 927 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1248 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  27.92 
 
 		 287 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  36.36 
 
 		 189 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 878 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 237 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1005 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1121 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.68 
 
 		 810 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  29.75 
 
 		 237 aa  51.2  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 1034 aa  51.2  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 331 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.21 
 
 		 758 aa  50.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  28.89 
 
 		 328 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 565 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.85 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 409 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  31.68 
 
 		 326 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  24.84 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 349 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 		 293 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1542  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000957604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  32.05 
 
 		 573 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 585 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1276 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 323 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.65 
 
 		 1694 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 222 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.39 
 
 		 344 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 344 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 715 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 383 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.11 
 
 		 695 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 2240 aa  47.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 361 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.53 
 
 		 576 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  33.66 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  30 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 833 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 717 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  25.48 
 
 		 255 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 188 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  29.92 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.87 
 
 		 878 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  31.13 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 366 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 2262 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 320 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.71 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 1737 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1406 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 754 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 289 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>