80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1614 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  100 
 
 		 585 aa  1201    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  35.86 
 
 		 493 aa  153  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7063  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 664 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2349  hypothetical protein  34.09 
 
 		 292 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5580  hypothetical protein  28.14 
 
 		 352 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6246  hypothetical protein  27.01 
 
 		 384 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243326  normal  0.363078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1123  hypothetical protein  26.29 
 
 		 425 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  37.21 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  38.41 
 
 		 271 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0156  hypothetical protein  26.98 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  35.83 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  32.61 
 
 		 305 aa  67  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  39.53 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  39.53 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  34.17 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  29.75 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  29.75 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  31.39 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  36.19 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  27.04 
 
 		 252 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  36.21 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  30.61 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.57 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  31.3 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  29.85 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  34.92 
 
 		 313 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30 
 
 		 154 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  29.63 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  34.04 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  31.76 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  32.26 
 
 		 355 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5367  hypothetical protein  23.86 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.128779  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  39.22 
 
 		 302 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30.25 
 
 		 317 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.15 
 
 		 262 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  30.51 
 
 		 304 aa  54.3  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.32 
 
 		 291 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  28.45 
 
 		 182 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  29.37 
 
 		 306 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  33.67 
 
 		 310 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  29.25 
 
 		 182 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  34.33 
 
 		 304 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  34.33 
 
 		 304 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  34.33 
 
 		 304 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  35.82 
 
 		 304 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  34.53 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  32.69 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  31.09 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  34.12 
 
 		 184 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  28.04 
 
 		 250 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  26.21 
 
 		 306 aa  48.5  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 520 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  32.22 
 
 		 310 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 305 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  33.05 
 
 		 374 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1305  hypothetical protein  24.48 
 
 		 413 aa  47.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 308 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  23.53 
 
 		 193 aa  47  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  26.55 
 
 		 328 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  28.95 
 
 		 171 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  26.89 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  30.51 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5336  hypothetical protein  32.8 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.975729  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  28.45 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  30.97 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  28.28 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  30.4 
 
 		 345 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  32.31 
 
 		 250 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  34.33 
 
 		 311 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  32.22 
 
 		 293 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  35.56 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  28.7 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  28.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 303 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  26.5 
 
 		 312 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  35.8 
 
 		 296 aa  44.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  32.97 
 
 		 297 aa  44.3  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>