15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5367 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5367  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  834    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.128779  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0049  hypothetical protein  50.62 
 
 
401 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722506  hitchhiker  0.00143766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1305  hypothetical protein  36.52 
 
 
413 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1344  hypothetical protein  31.64 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2573  hypothetical protein  28.7 
 
 
386 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.298255  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2121  hypothetical protein  50 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1752  hypothetical protein  29.68 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0331  hypothetical protein  26.36 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1130  hypothetical protein  45.71 
 
 
175 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.659523  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0895  hypothetical protein  39.47 
 
 
77 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  23.86 
 
 
585 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0865  hypothetical protein  40.68 
 
 
114 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0032  hypothetical protein  48.15 
 
 
323 aa  49.7  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  47.17 
 
 
570 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3340  hypothetical protein  28.43 
 
 
237 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>