44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3785 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1160    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  64.71 
 
 		 413 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  50.88 
 
 		 244 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  49.55 
 
 		 295 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5833  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 291 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.077855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4470  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 291 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3898  putative lipoprotein  52.68 
 
 		 291 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.32 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  49.4 
 
 		 339 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  43.06 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  37.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  37.21 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1130  hypothetical protein  49.3 
 
 		 175 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.659523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  36.49 
 
 		 166 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2121  hypothetical protein  49.06 
 
 		 374 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0895  hypothetical protein  46.97 
 
 		 77 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1344  hypothetical protein  43.66 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0032  hypothetical protein  41.67 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  32.29 
 
 		 262 aa  51.6  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2573  hypothetical protein  48.21 
 
 		 386 aa  51.2  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.298255  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  35.06 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  40.58 
 
 		 334 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5367  hypothetical protein  47.17 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.128779  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  35.06 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  34.48 
 
 		 307 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  38.03 
 
 		 315 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  35.06 
 
 		 245 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0865  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  35.48 
 
 		 254 aa  48.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3982  hypothetical protein  59.52 
 
 		 53 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.993592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3268  hypothetical protein  46.81 
 
 		 125 aa  47.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  38.1 
 
 		 214 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  35.06 
 
 		 100 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  34.78 
 
 		 254 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1305  hypothetical protein  28.4 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  33.66 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2111  hypothetical protein  45.1 
 
 		 63 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  52.78 
 
 		 208 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  30.49 
 
 		 339 aa  44.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  36.96 
 
 		 225 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  31.65 
 
 		 277 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  29.76 
 
 		 479 aa  43.5  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  30.86 
 
 		 272 aa  43.5  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>