76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1094 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  100 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  46.75 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  46.95 
 
 		 305 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  45.48 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  45.02 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  44.23 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  46.95 
 
 		 305 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  47.74 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  45.66 
 
 		 302 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  39.42 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  39.42 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  44.48 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  44.48 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  40.72 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  41.33 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  40.65 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  41.21 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  37.22 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  39.87 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  41.56 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  36.07 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  40.72 
 
 		 304 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  40 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  37.66 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  40 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  38.06 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  37.74 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  37.74 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  33.75 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  34.59 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  27.88 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  44.55 
 
 		 128 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  28.24 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  27.46 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  27.75 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.71 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  27.3 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  26.11 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  28.72 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  34.04 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  23.38 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  34.01 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  32.87 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  36.43 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  45.16 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  22.73 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  41.43 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  36.89 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  33.61 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  33.13 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  33.61 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.73 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  33.61 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  31.15 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  33.61 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  25.63 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  24.64 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  33.67 
 
 		 585 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.71 
 
 		 421 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  28.44 
 
 		 609 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  28.44 
 
 		 609 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  37.93 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  30.36 
 
 		 374 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  34.68 
 
 		 799 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  23.86 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  34.68 
 
 		 799 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  31.15 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  40.58 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  29.66 
 
 		 196 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  29.23 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  35.56 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  33.9 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>