37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3938 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  795    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  35.82 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  29.41 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  24.36 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  29.55 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  31.25 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  33.93 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  25.15 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.25 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  27.12 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  35.16 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 237 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  27.74 
 
 		 326 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  23.89 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  27.41 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  28.03 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  31.63 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  29.69 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  22.76 
 
 		 248 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  25.37 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  25.37 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  34.62 
 
 		 125 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  32.29 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  29.22 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  34.62 
 
 		 154 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  34.62 
 
 		 154 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  25.86 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  31.31 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  36.84 
 
 		 1131 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 230 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  27.35 
 
 		 222 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 310 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  28.79 
 
 		 293 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  27.56 
 
 		 305 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  27.37 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  33.65 
 
 		 154 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>