67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1873 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  30.51 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  32.44 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  33.55 
 
 
302 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  30.83 
 
 
305 aa  122  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  27.87 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  28.43 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  31.08 
 
 
306 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  31.56 
 
 
305 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  27.15 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  29.67 
 
 
296 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  31.25 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  31.34 
 
 
293 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  28.86 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  29.43 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  26.56 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  33.21 
 
 
302 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  30.62 
 
 
304 aa  105  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  29.77 
 
 
310 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  29.45 
 
 
310 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  27.67 
 
 
310 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  27.18 
 
 
303 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  31.08 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  30.92 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  27.37 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  27.37 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  25.08 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  24.5 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  24.5 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  26.49 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  26.56 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  24.17 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  33.61 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  24.44 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  31.03 
 
 
219 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  24.44 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  22.67 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  30.67 
 
 
349 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  34.58 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  24.15 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  26.04 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.22 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  29.29 
 
 
799 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  30.65 
 
 
215 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  29.29 
 
 
799 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  23.95 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  21.82 
 
 
300 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  26.34 
 
 
286 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  32.61 
 
 
403 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  25.4 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  29.52 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  29.52 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  31.63 
 
 
384 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.86 
 
 
305 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  26.67 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  32.71 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  25.41 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  21.05 
 
 
454 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  25.22 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  31.25 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.33 
 
 
222 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  29.3 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  26.87 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  27.05 
 
 
493 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  28.39 
 
 
313 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  30.51 
 
 
364 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>