58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1753 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  35.24 
 
 
305 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  33.78 
 
 
302 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  31.22 
 
 
293 aa  84.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  31.98 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  34.59 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  34.46 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  35.71 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  35 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  32.75 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  36.76 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  34.78 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  27.75 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  36 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  33.33 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  26.27 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  35.11 
 
 
303 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  26.2 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  30.63 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  32.61 
 
 
304 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  26.36 
 
 
306 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  26.17 
 
 
305 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  36.76 
 
 
297 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  26.17 
 
 
305 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  31.52 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  41.07 
 
 
128 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  28.12 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  35.9 
 
 
421 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  32.16 
 
 
291 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  34.06 
 
 
311 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  29.93 
 
 
349 aa  58.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.07 
 
 
374 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  32.16 
 
 
291 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  31.02 
 
 
296 aa  56.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  32.82 
 
 
304 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  32.82 
 
 
304 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  32.82 
 
 
304 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  28.78 
 
 
454 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  31.31 
 
 
288 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  30.65 
 
 
297 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.75 
 
 
305 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  29.45 
 
 
304 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  30.99 
 
 
299 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  29.59 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  29.35 
 
 
325 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  29.03 
 
 
154 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  26.87 
 
 
349 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  29.2 
 
 
345 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  29.03 
 
 
154 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  29.29 
 
 
346 aa  45.1  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  29.51 
 
 
125 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  34.29 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  27.5 
 
 
301 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  31.58 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  28.23 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  26.49 
 
 
317 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.13 
 
 
333 aa  42  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  26.98 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>