100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0091 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  100 
 
 
305 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  60.86 
 
 
302 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  57.42 
 
 
310 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  56.77 
 
 
310 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  58.55 
 
 
303 aa  355  5e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  54.28 
 
 
303 aa  346  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  57.95 
 
 
305 aa  345  4e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  51.64 
 
 
304 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  50 
 
 
305 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  57.28 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  54.66 
 
 
302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  52.03 
 
 
293 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  48.36 
 
 
297 aa  289  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  47.71 
 
 
304 aa  281  9e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  46.3 
 
 
310 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  46.41 
 
 
302 aa  258  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  44.69 
 
 
312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  45.42 
 
 
305 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  39.09 
 
 
306 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  45.42 
 
 
305 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  38.24 
 
 
307 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  41.12 
 
 
306 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  41.75 
 
 
311 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  40.2 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  37.46 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  37.86 
 
 
304 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  37.86 
 
 
304 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  37.86 
 
 
304 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  38.06 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  37.13 
 
 
304 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.99 
 
 
291 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  31.56 
 
 
297 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  49.57 
 
 
128 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  31.1 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  31.1 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  30.34 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  32.94 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  28.32 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  35.24 
 
 
215 aa  89.4  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.64 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  26.95 
 
 
454 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  26.74 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  28.85 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  31.37 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.1 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.82 
 
 
493 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  36.29 
 
 
125 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  38.46 
 
 
154 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  32.64 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  31.39 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  38.46 
 
 
154 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  33.33 
 
 
493 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  38.46 
 
 
154 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  29.85 
 
 
447 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  33.08 
 
 
349 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  30.6 
 
 
454 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  34.4 
 
 
421 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  29.85 
 
 
454 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  33.33 
 
 
346 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  31.25 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  30.51 
 
 
609 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  30.51 
 
 
609 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  29.1 
 
 
454 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  34.68 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  34.15 
 
 
450 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  27.61 
 
 
454 aa  52.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.84 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  29.41 
 
 
455 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.97 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  28.23 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  33.65 
 
 
184 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  35.19 
 
 
219 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  27.17 
 
 
333 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  24.31 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  34.04 
 
 
440 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  34.04 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1903  restriction endonuclease  30.65 
 
 
640 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  hitchhiker  0.0000000420934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  31.4 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  31.93 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  27.56 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  30.77 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  30.58 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  27.88 
 
 
196 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  27.07 
 
 
453 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  29.82 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  26.13 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  27.27 
 
 
187 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  32.17 
 
 
182 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27.19 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  26.13 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  28.21 
 
 
171 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  25.29 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  32.46 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  34.43 
 
 
193 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  30.25 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  33.87 
 
 
70 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  28.68 
 
 
208 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  33.71 
 
 
169 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  25.49 
 
 
326 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  29.09 
 
 
585 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>