73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3348 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  100 
 
 		 299 aa  613  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  41.22 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  37.75 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  37.42 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  35.69 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  35.74 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  33.21 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  32.71 
 
 		 454 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  36.46 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  29.97 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  30.13 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  27.47 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  25.41 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  26.64 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  26.3 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  29.1 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  26.1 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  26.69 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  26.22 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  25.18 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  26.16 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  23.51 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  24.25 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  23.51 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  26.6 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  23.51 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  23.21 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  28.46 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  25.35 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  25 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.5 
 
 		 493 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  28.05 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  27.96 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  25.62 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  25.62 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  34.56 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  25.72 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  31.85 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  27.41 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  29.92 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  31.16 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  25.26 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  26.22 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 493 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  32.37 
 
 		 421 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  25.44 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  27.42 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  31.5 
 
 		 450 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  30.99 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  27.83 
 
 		 364 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  25.62 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  30.71 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  30.33 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 799 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 799 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  22.83 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  29.32 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.86 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  28.93 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 193 aa  45.8  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  28.44 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  28.7 
 
 		 585 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  26.83 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  29.07 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  29.22 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  24.68 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  20.83 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0618  hypothetical protein  34.52 
 
 		 200 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0285766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  26.23 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  24.84 
 
 		 440 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  24.84 
 
 		 327 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>