53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1131 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  100 
 
 		 450 aa  928    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  37.06 
 
 		 447 aa  262  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  29.32 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  27.59 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 455 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  28.34 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  28.54 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  27.01 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  37.4 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  30.67 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  30.66 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.77 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.75 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  30.88 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  34.69 
 
 		 208 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  34.85 
 
 		 302 aa  53.5  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  32.12 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  32 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  34.15 
 
 		 305 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  31.5 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.5 
 
 		 349 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  31.21 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  30 
 
 		 304 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.78 
 
 		 154 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  31.48 
 
 		 271 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.78 
 
 		 154 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  26.62 
 
 		 349 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  30.84 
 
 		 345 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  31.78 
 
 		 125 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.78 
 
 		 154 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  32.41 
 
 		 330 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 230 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.3 
 
 		 302 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 237 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  35.38 
 
 		 1131 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  31.78 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  30.47 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  29.37 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  29.23 
 
 		 304 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  33.08 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  30.92 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  36 
 
 		 328 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  30 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 325 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.31 
 
 		 305 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  30 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>