49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2515 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  100 
 
 		 237 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  52.89 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  36.28 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.69 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  36.22 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  38.52 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  34.21 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  34.38 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  33.14 
 
 		 368 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  38.1 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3506  restriction endonuclease  32.88 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.31 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  30.14 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.86 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  33.06 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  35 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5134  restriction endonuclease  29.32 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360848  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  37.12 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  33.06 
 
 		 498 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  29.37 
 
 		 520 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  29.82 
 
 		 384 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  28.78 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 312 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  30.07 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 455 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  27.82 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  28.07 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  32.08 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 450 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  28.07 
 
 		 154 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  28.07 
 
 		 154 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 303 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  27.64 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  29.82 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  33.08 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  31.58 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  32.56 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  29.06 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  25.4 
 
 		 301 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.23 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  32.43 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  29.09 
 
 		 355 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>