85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1586 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  100 
 
 		 304 aa  610  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  43 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  40.66 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  40.72 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  37.62 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  37.83 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  39.16 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  40.2 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  40.07 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  41.56 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  41.56 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  40.45 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  38.64 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  39.33 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  37.46 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  38.56 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  36.6 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  35.16 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  38.69 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  35.16 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  36.6 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  39.61 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  38.44 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  33.12 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  38.06 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  36.42 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  36.42 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  36.36 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  35.44 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  27.87 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  44.09 
 
 		 128 aa  102  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  30.28 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  28 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  29.35 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  28 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  28.43 
 
 		 454 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  29.66 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  38.58 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  38.58 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  28.25 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  24.25 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  26.27 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  30.22 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.14 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  34.09 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.56 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.87 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  39.5 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  37.76 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 271 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  28.48 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  29.14 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  30.51 
 
 		 585 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  29.09 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  35.04 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  27.5 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  29.27 
 
 		 345 aa  49.7  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  30.08 
 
 		 196 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  33.33 
 
 		 440 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  29.75 
 
 		 252 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  35.4 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  29.37 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  28.57 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  34.85 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  28.03 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  34.85 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  29.27 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  27.78 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  33.33 
 
 		 400 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  31.96 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  30.34 
 
 		 230 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 799 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  34.51 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 799 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 498 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  26.4 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  29.2 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.2 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>