37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7364 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  100 
 
 		 400 aa  831    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  46.19 
 
 		 403 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  29.41 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  31.76 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  29.73 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  34.75 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.29 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  31.58 
 
 		 307 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  26.58 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  27.13 
 
 		 320 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  27.34 
 
 		 326 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  27.97 
 
 		 248 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  30.19 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  27.4 
 
 		 196 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.19 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  22.97 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  22.86 
 
 		 440 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  31.86 
 
 		 493 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  29.75 
 
 		 184 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  32.69 
 
 		 585 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  32.71 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  31.62 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  26.72 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  32.71 
 
 		 289 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  30.08 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  26.42 
 
 		 252 aa  46.6  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  28.44 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  29.03 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  25.41 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  33.33 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  30.91 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30 
 
 		 262 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  35.56 
 
 		 310 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  29.9 
 
 		 171 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  28.16 
 
 		 348 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  30.11 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>