102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1324 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  100 
 
 		 493 aa  990    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  38.46 
 
 		 349 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  39.61 
 
 		 291 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  39.87 
 
 		 374 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  39.01 
 
 		 345 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  39.01 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  30.5 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.1 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  36.62 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  32.76 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  39.1 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4934  hypothetical protein  45.21 
 
 		 112 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.476591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  36.54 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  33.1 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  33.1 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.81 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  29.09 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  35.94 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  35.57 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  33.76 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  34.04 
 
 		 304 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  31.76 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  29.75 
 
 		 302 aa  66.6  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  32.7 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  32.7 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  31.67 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  33.96 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  32.7 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  31.61 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  35.25 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  35 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  29.01 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 311 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  34.68 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  28.08 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1635  hypothetical protein  30.08 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  29.27 
 
 		 326 aa  57  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  28.48 
 
 		 310 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.15 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  29.09 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  31.37 
 
 		 307 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  31.2 
 
 		 171 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  26.4 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 184 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2225  hypothetical protein  31.36 
 
 		 624 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00433627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2313  hypothetical protein  31.36 
 
 		 624 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  29.65 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  27.95 
 
 		 305 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  28.77 
 
 		 669 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  32.03 
 
 		 304 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  25.24 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.16 
 
 		 154 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.16 
 
 		 154 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.16 
 
 		 154 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  32.65 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 297 aa  54.3  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  25.98 
 
 		 128 aa  53.9  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  30.28 
 
 		 453 aa  53.5  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  31.71 
 
 		 125 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  28.37 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  33.03 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  26.45 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  29.08 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  25.81 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1768  hypothetical protein  38.96 
 
 		 584 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.530857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  30.17 
 
 		 182 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  30.7 
 
 		 342 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  32.79 
 
 		 338 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  30.91 
 
 		 152 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  25.81 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  27.45 
 
 		 306 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  30 
 
 		 144 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  26.39 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  29.09 
 
 		 386 aa  47.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  28.45 
 
 		 585 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  30.97 
 
 		 247 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  26.53 
 
 		 328 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0225  hypothetical protein  22.73 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  30.61 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  30.61 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  27.59 
 
 		 182 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  28.81 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  38.89 
 
 		 1131 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  31.18 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  29.6 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  29.9 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  27.93 
 
 		 201 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.37 
 
 		 222 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 346 aa  44.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  30.63 
 
 		 249 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5054  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  26.71 
 
 		 297 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  27.52 
 
 		 145 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>