44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01945 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  806    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  44.12 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  36.88 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  29.73 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 271 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.53 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  28.93 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  29.77 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.53 
 
 		 154 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  29.77 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.26 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  31.01 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  34.09 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  28.15 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  32.56 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  26.67 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  28.93 
 
 		 440 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  28.93 
 
 		 327 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 230 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  36.73 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  26.73 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.09 
 
 		 493 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  29.89 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  28.42 
 
 		 326 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 262 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 310 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  26.67 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  32.95 
 
 		 1131 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  27.36 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  32.5 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  26.61 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2800  restriction endonuclease  33.03 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  28.35 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  27.03 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2103  restriction endonuclease  25.23 
 
 		 248 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.0521143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  28.07 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  26.52 
 
 		 196 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>