12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2800 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2800  restriction endonuclease  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  43.24 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  42.34 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  38.17 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  39.13 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 312 aa  50.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  33.03 
 
 		 386 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  27.98 
 
 		 306 aa  45.1  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  29.76 
 
 		 296 aa  42.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  27.27 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 493 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>