72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1622 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  47.46 
 
 		 520 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  48.31 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  41.73 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  44.83 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  44.83 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  44.83 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  43.86 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  44.8 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  44.8 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  39.83 
 
 		 421 aa  91.3  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  38.69 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  35.19 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  40.95 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  40.37 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  37.84 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  36.21 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  36.67 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  36.75 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  37.3 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1248 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  34.09 
 
 		 1291 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  35.48 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  37.29 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  36.52 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  35.19 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  30.77 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  36.7 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  32.76 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.91 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  38.18 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  37.93 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  30.28 
 
 		 326 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  31.48 
 
 		 453 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  35.34 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  43.42 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  25.49 
 
 		 359 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  33.33 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  26.32 
 
 		 328 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  35.42 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0870  hypothetical protein  26.27 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  32.41 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 455 aa  48.5  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  35.23 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  33.33 
 
 		 125 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  34.23 
 
 		 498 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  27.73 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  27.48 
 
 		 454 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  29.52 
 
 		 454 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  28.47 
 
 		 493 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  26.72 
 
 		 454 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  29.66 
 
 		 355 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  27.73 
 
 		 252 aa  45.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.39 
 
 		 374 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.47 
 
 		 450 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  29.69 
 
 		 320 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  30.16 
 
 		 1131 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  26.89 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  34.52 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  27.03 
 
 		 386 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  32.73 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  31.15 
 
 		 326 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  28.23 
 
 		 1259 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 262 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  27.97 
 
 		 493 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  25.62 
 
 		 345 aa  41.6  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 310 aa  41.6  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 585 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>