13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1255 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  100 
 
 
498 aa  991    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  30.36 
 
 
368 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  33.06 
 
 
237 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.5 
 
 
349 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  38.04 
 
 
359 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  30.71 
 
 
219 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  34.23 
 
 
207 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  36.05 
 
 
306 aa  48.5  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  32.97 
 
 
307 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  30.08 
 
 
493 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  29.03 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  31.25 
 
 
304 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  33.33 
 
 
364 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>