37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1093 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  100 
 
 		 341 aa  697    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  44.44 
 
 		 351 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  42.15 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  43.68 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  48 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  39.77 
 
 		 346 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  35.73 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  29.88 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  30.45 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  30.75 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  31.36 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  28.82 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  27.38 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  28.27 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.36 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  36.3 
 
 		 161 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  34.38 
 
 		 208 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  34.84 
 
 		 853 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  35.62 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0519  hypothetical protein  32.2 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  31.06 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  29.11 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  30.43 
 
 		 805 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.5 
 
 		 683 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  25.95 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  29.52 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  26.09 
 
 		 182 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0382  hypothetical protein  25.86 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  26.96 
 
 		 182 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 493 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  35.42 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.43 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.43 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3277  hypothetical protein  31.48 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  23.86 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  32.97 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>