19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0382 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0382  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0868  hypothetical protein  61.72 
 
 
320 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.659521  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0903  hypothetical protein  40.65 
 
 
301 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0994  hypothetical protein  40.84 
 
 
306 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15830  hypothetical protein  60 
 
 
165 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0074836  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2725  hypothetical protein  59.33 
 
 
159 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.272693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0279  hypothetical protein  59.87 
 
 
162 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.75835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2739  hypothetical protein  59.33 
 
 
159 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0625393  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2695  hypothetical protein  59.33 
 
 
159 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0239  hypothetical protein  60 
 
 
156 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.444168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2031  putative cytoplasmic protein  58 
 
 
155 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2194  hypothetical protein  58.67 
 
 
161 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2879  putative cytoplasmic protein  58.94 
 
 
162 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1814  hypothetical protein  57.82 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0365  hypothetical protein  36.99 
 
 
184 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1351  hypothetical protein  35.2 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.206978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0257  hypothetical protein  34.3 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00139853  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0845  hypothetical protein  34.34 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.611769 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  25.86 
 
 
341 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>