18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1814 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1814  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  613  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2031  putative cytoplasmic protein  58.39 
 
 
155 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15830  hypothetical protein  56.38 
 
 
165 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0074836  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2725  hypothetical protein  56.38 
 
 
159 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.272693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2739  hypothetical protein  56.38 
 
 
159 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0625393  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2194  hypothetical protein  55.48 
 
 
161 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2695  hypothetical protein  56.38 
 
 
159 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0868  hypothetical protein  56.08 
 
 
320 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.659521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0382  hypothetical protein  57.82 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0279  hypothetical protein  53.95 
 
 
162 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.75835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0903  hypothetical protein  52.74 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0994  hypothetical protein  51.37 
 
 
306 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0239  hypothetical protein  54 
 
 
156 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.444168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2879  putative cytoplasmic protein  52.9 
 
 
162 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1351  hypothetical protein  35.57 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.206978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0365  hypothetical protein  35.42 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0257  hypothetical protein  36.69 
 
 
184 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00139853  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0845  hypothetical protein  34.04 
 
 
187 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.611769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>