18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0279 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0279  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  331  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.75835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0239  hypothetical protein  92.31 
 
 
156 aa  290  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.444168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2194  hypothetical protein  72.9 
 
 
161 aa  227  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15830  hypothetical protein  70.97 
 
 
165 aa  226  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0074836  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2031  putative cytoplasmic protein  71.15 
 
 
155 aa  221  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2695  hypothetical protein  69.87 
 
 
159 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2739  hypothetical protein  69.87 
 
 
159 aa  220  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0625393  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2725  hypothetical protein  69.23 
 
 
159 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.272693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2879  putative cytoplasmic protein  65.16 
 
 
162 aa  200  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0382  hypothetical protein  59.87 
 
 
299 aa  161  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1814  hypothetical protein  53.95 
 
 
317 aa  152  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0903  hypothetical protein  53.64 
 
 
301 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0994  hypothetical protein  51.32 
 
 
306 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0868  hypothetical protein  56.49 
 
 
320 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.659521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1351  hypothetical protein  32.45 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.206978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0365  hypothetical protein  37.16 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0257  hypothetical protein  36.05 
 
 
184 aa  57.4  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00139853  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0845  hypothetical protein  32.65 
 
 
187 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.611769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>