20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0868 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0868  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  624  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.659521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0382  hypothetical protein  61.72 
 
 
299 aa  318  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0994  hypothetical protein  40.63 
 
 
306 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0903  hypothetical protein  39.81 
 
 
301 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1814  hypothetical protein  56.29 
 
 
317 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2031  putative cytoplasmic protein  56.69 
 
 
155 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0279  hypothetical protein  56.33 
 
 
162 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.75835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15830  hypothetical protein  52.07 
 
 
165 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0074836  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2725  hypothetical protein  52.56 
 
 
159 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.272693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2739  hypothetical protein  52.56 
 
 
159 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0625393  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2695  hypothetical protein  52.56 
 
 
159 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0239  hypothetical protein  54.37 
 
 
156 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.444168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2194  hypothetical protein  52.56 
 
 
161 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2879  putative cytoplasmic protein  50 
 
 
162 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1351  hypothetical protein  35.62 
 
 
185 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.206978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0365  hypothetical protein  37.41 
 
 
184 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0845  hypothetical protein  29.8 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.611769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0257  hypothetical protein  39.81 
 
 
184 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00139853  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  26.83 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  30.16 
 
 
346 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>