16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2750 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  34.38 
 
 
341 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  28.35 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  28.8 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  29.92 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  33.04 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  30 
 
 
351 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  38.37 
 
 
301 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  36 
 
 
845 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  25.81 
 
 
805 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  27.56 
 
 
347 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  29.13 
 
 
345 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  23.53 
 
 
853 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  26.67 
 
 
328 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  27.27 
 
 
161 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0868  hypothetical protein  26.83 
 
 
320 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.659521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>