18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0239 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0239  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.444168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0279  hypothetical protein  92.31 
 
 		 162 aa  290  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.75835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2194  hypothetical protein  71.9 
 
 		 161 aa  227  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15830  hypothetical protein  71.24 
 
 		 165 aa  227  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0074836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2695  hypothetical protein  71.9 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2739  hypothetical protein  71.9 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0625393  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2725  hypothetical protein  71.24 
 
 		 159 aa  224  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.272693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2031  putative cytoplasmic protein  71.43 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2879  putative cytoplasmic protein  64.71 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0382  hypothetical protein  60 
 
 		 299 aa  160  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0903  hypothetical protein  52.35 
 
 		 301 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0994  hypothetical protein  51.68 
 
 		 306 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1814  hypothetical protein  54 
 
 		 317 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0868  hypothetical protein  54.9 
 
 		 320 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.659521  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0365  hypothetical protein  37.93 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0257  hypothetical protein  36.81 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00139853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1351  hypothetical protein  36.54 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.206978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0845  hypothetical protein  31.87 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.611769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>