25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3625 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  694    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  54.7 
 
 
351 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  40.57 
 
 
347 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  39.77 
 
 
341 aa  259  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  37.84 
 
 
301 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  32.75 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  33.63 
 
 
346 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.36 
 
 
333 aa  137  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  25.22 
 
 
328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  29.15 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  29.5 
 
 
271 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.28 
 
 
333 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  27.04 
 
 
363 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  27.06 
 
 
342 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.48 
 
 
345 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  28.35 
 
 
208 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  27.59 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  31.38 
 
 
300 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  37.08 
 
 
853 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  27.21 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0519  hypothetical protein  24.74 
 
 
124 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  29.03 
 
 
421 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  31.71 
 
 
805 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  27.08 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  27.61 
 
 
230 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>