90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0968 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  100 
 
 		 305 aa  621  1e-177  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  57.24 
 
 		 302 aa  352  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  57.95 
 
 		 305 aa  345  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  56.09 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  55.45 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  53.77 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  56.63 
 
 		 303 aa  335  7e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  52.79 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  52.79 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  53.92 
 
 		 302 aa  320  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  52.96 
 
 		 297 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  50.67 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  53.11 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  46.75 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  45.81 
 
 		 312 aa  267  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  43.56 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  43.09 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  45.72 
 
 		 305 aa  247  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  45.72 
 
 		 305 aa  247  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  38.49 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  41.37 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  39.34 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  37.83 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  36.3 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  37.9 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  40.06 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  37.46 
 
 		 304 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  37.13 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  37.13 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  35.5 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  49.17 
 
 		 128 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  30.19 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  28.12 
 
 		 454 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  27.89 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  27.78 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  28.38 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  28.22 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  25.41 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  25.35 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  36.76 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  34.07 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  34.97 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  34.85 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.61 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.21 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  28.96 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.66 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  28.75 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  28.75 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  28.75 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  30.19 
 
 		 609 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  30.19 
 
 		 609 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 262 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  34.45 
 
 		 421 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  29.24 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  28.23 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  36.11 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.63 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  36.11 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  26.92 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  28.38 
 
 		 493 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  27.15 
 
 		 289 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  28.37 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  30.63 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  32.46 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  30.51 
 
 		 585 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  30.3 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  27.64 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.87 
 
 		 799 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  29.57 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.87 
 
 		 799 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  26.61 
 
 		 493 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  25.19 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  28.35 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0984  hypothetical protein  23.08 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.85 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  32.32 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 454 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01170  DNA repair protein rad8, putative  32.35 
 
 		 1856 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  33.73 
 
 		 440 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.73 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  29.37 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 454 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  36.26 
 
 		 169 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  29.79 
 
 		 450 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>