81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3469 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 851 aa  1761    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.71 
 
 		 530 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.85 
 
 		 685 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  35.95 
 
 		 691 aa  240  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  36.43 
 
 		 685 aa  231  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  40.66 
 
 		 678 aa  195  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  49.08 
 
 		 687 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  44.8 
 
 		 587 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.5 
 
 		 722 aa  187  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  55.83 
 
 		 834 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  43.75 
 
 		 845 aa  185  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  56.79 
 
 		 662 aa  182  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  30.11 
 
 		 498 aa  181  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  47.17 
 
 		 603 aa  180  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  51.83 
 
 		 517 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  50 
 
 		 517 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.91 
 
 		 723 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  30.99 
 
 		 498 aa  178  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.47 
 
 		 481 aa  177  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  39.72 
 
 		 999 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  44.55 
 
 		 862 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  50.6 
 
 		 696 aa  168  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.4 
 
 		 822 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.29 
 
 		 765 aa  165  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  42.8 
 
 		 705 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.26 
 
 		 683 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  42.34 
 
 		 900 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  35.79 
 
 		 700 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  43.66 
 
 		 605 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  53.74 
 
 		 598 aa  147  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.51 
 
 		 754 aa  145  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.12 
 
 		 732 aa  134  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.88 
 
 		 398 aa  132  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.34 
 
 		 421 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  32.03 
 
 		 666 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  36.06 
 
 		 459 aa  127  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  36.06 
 
 		 459 aa  127  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.32 
 
 		 465 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  34.29 
 
 		 539 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.71 
 
 		 502 aa  124  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  33.33 
 
 		 638 aa  122  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  41.04 
 
 		 571 aa  120  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.98 
 
 		 626 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  34.59 
 
 		 805 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.29 
 
 		 590 aa  111  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  32.1 
 
 		 629 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.89 
 
 		 568 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  32.16 
 
 		 743 aa  107  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  31.76 
 
 		 609 aa  105  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  31.76 
 
 		 609 aa  105  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  31.46 
 
 		 734 aa  104  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  29 
 
 		 781 aa  104  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  29.96 
 
 		 899 aa  104  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.16 
 
 		 743 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.71 
 
 		 729 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  31.76 
 
 		 810 aa  102  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  32.92 
 
 		 853 aa  101  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.65 
 
 		 698 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  30.68 
 
 		 741 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.93 
 
 		 603 aa  83.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  33.52 
 
 		 655 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  25.52 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  29.41 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.17 
 
 		 795 aa  74.7  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3277  hypothetical protein  34.43 
 
 		 154 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.69 
 
 		 449 aa  73.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  29.41 
 
 		 450 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  28.25 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  27.41 
 
 		 513 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.04 
 
 		 585 aa  68.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  30.05 
 
 		 352 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  25.78 
 
 		 938 aa  62  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  33.88 
 
 		 653 aa  62  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.21 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  29.91 
 
 		 333 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.15 
 
 		 748 aa  50.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  23.98 
 
 		 668 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.17 
 
 		 530 aa  46.6  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  25 
 
 		 391 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.9 
 
 		 410 aa  46.2  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  30.77 
 
 		 803 aa  45.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>