82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7438 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  100 
 
 
696 aa  1436    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  46.1 
 
 
517 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.98 
 
 
723 aa  340  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  38.15 
 
 
834 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  40.79 
 
 
862 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  64.09 
 
 
517 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  37.71 
 
 
662 aa  278  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  58.74 
 
 
900 aa  250  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  35.91 
 
 
598 aa  243  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  53.6 
 
 
722 aa  232  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  53.54 
 
 
605 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  53.08 
 
 
687 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  52.08 
 
 
845 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.1 
 
 
685 aa  204  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  46.78 
 
 
678 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  56.47 
 
 
603 aa  200  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  51.79 
 
 
587 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  50 
 
 
691 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  49.75 
 
 
685 aa  188  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.5 
 
 
530 aa  187  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  50.6 
 
 
851 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  42.01 
 
 
700 aa  153  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  49.08 
 
 
822 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  44.13 
 
 
999 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.03 
 
 
683 aa  144  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.8 
 
 
765 aa  140  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  48.08 
 
 
705 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  38.1 
 
 
498 aa  134  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  34.16 
 
 
498 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  38.07 
 
 
666 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.24 
 
 
398 aa  123  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  38.04 
 
 
571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.88 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.25 
 
 
754 aa  117  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.46 
 
 
421 aa  116  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.22 
 
 
732 aa  115  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  40.11 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.89 
 
 
743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  40.11 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  36.46 
 
 
609 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  36.46 
 
 
609 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  39.33 
 
 
743 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40 
 
 
465 aa  110  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  35.24 
 
 
734 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  42.11 
 
 
698 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  35.75 
 
 
805 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  35.27 
 
 
781 aa  104  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.13 
 
 
626 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.65 
 
 
502 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  39.39 
 
 
853 aa  101  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.37 
 
 
568 aa  101  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  37.08 
 
 
810 aa  100  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.97 
 
 
729 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  36 
 
 
539 aa  97.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  35.63 
 
 
899 aa  95.5  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  35.82 
 
 
741 aa  94.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  32.28 
 
 
638 aa  92.8  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  37.04 
 
 
629 aa  90.5  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.76 
 
 
590 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.6 
 
 
603 aa  84.7  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  39.07 
 
 
655 aa  84.7  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.58 
 
 
795 aa  75.1  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  35.66 
 
 
303 aa  73.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.98 
 
 
585 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.55 
 
 
510 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  37.5 
 
 
412 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  29.17 
 
 
450 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  24 
 
 
352 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.5 
 
 
449 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  30.39 
 
 
653 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.59 
 
 
410 aa  51.2  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  29.8 
 
 
347 aa  50.8  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  30.82 
 
 
714 aa  49.7  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  30.82 
 
 
714 aa  49.7  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  22.92 
 
 
597 aa  48.5  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0225  conserved hypothetical protein, putative endonuclease  59.38 
 
 
208 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.131581  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.84 
 
 
748 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  27.62 
 
 
513 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  26 
 
 
513 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  26.47 
 
 
792 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  32.97 
 
 
524 aa  44.3  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  36.26 
 
 
803 aa  43.9  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>