44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3686 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  100 
 
 		 421 aa  830    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  37.37 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  31.62 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  29.92 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  31.19 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  30.19 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  33.01 
 
 		 149 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  37 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  32.84 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  33.59 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  35.96 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  31.78 
 
 		 529 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  32.29 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.08 
 
 		 628 aa  53.9  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  27.19 
 
 		 167 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  28.8 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  36.36 
 
 		 281 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  28.8 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 262 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  28.3 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  33.67 
 
 		 504 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  35.8 
 
 		 252 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29.41 
 
 		 289 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  32.14 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  28.45 
 
 		 271 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0117  putative lipoprotein  25.18 
 
 		 304 aa  46.6  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.63 
 
 		 154 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.78 
 
 		 154 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1819  restriction endonuclease  29.85 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.63 
 
 		 154 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 230 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  29.17 
 
 		 534 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  29.8 
 
 		 556 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 611 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 531 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 576 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.34 
 
 		 611 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  29.17 
 
 		 566 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  29.17 
 
 		 531 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.89 
 
 		 583 aa  43.1  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  32.06 
 
 		 589 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  29.17 
 
 		 531 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>