92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0147 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  100 
 
 
321 aa  644    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  37.55 
 
 
339 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  31.23 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  41.8 
 
 
155 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  39.81 
 
 
147 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  33.82 
 
 
165 aa  86.3  7e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  30.95 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  37.96 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  34.43 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  35.14 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  37.37 
 
 
421 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  28.46 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  29.94 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  34.88 
 
 
142 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.09 
 
 
449 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  32.14 
 
 
504 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  36.08 
 
 
471 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  31.19 
 
 
167 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  30.34 
 
 
522 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 
522 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  30.34 
 
 
522 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  30.34 
 
 
522 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  30.34 
 
 
522 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  30.34 
 
 
522 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  30.34 
 
 
522 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  30.11 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  28.57 
 
 
162 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1424  hypothetical protein  35.78 
 
 
149 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.05 
 
 
471 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  24.68 
 
 
174 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.02 
 
 
471 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  29.17 
 
 
161 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 
531 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  30.34 
 
 
556 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  28.97 
 
 
531 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  32.95 
 
 
529 aa  52.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  30.97 
 
 
531 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  30.97 
 
 
566 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.68 
 
 
466 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  31.78 
 
 
178 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  34.09 
 
 
534 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  29.03 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  29.21 
 
 
449 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  28.97 
 
 
576 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.25 
 
 
810 aa  49.3  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  27.1 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1423  hypothetical protein  36.46 
 
 
150 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.492323  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  29.13 
 
 
630 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  29 
 
 
611 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1913  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.13 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00493276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  25.49 
 
 
148 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  28.09 
 
 
449 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  25.58 
 
 
176 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.21 
 
 
609 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.17 
 
 
158 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  30.36 
 
 
406 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  28.64 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  30.53 
 
 
136 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  24.48 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4777  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.31 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1793  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2461  hypothetical protein  23.55 
 
 
435 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321455  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  29.25 
 
 
188 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1444  hypothetical protein  27.34 
 
 
130 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00624852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  26.87 
 
 
155 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  25.3 
 
 
531 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  27.89 
 
 
183 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  28.67 
 
 
197 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  23.16 
 
 
596 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  22.22 
 
 
133 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  25.74 
 
 
650 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
166 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.21 
 
 
612 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  32.14 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  32.14 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  29.35 
 
 
603 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  30.93 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  29.55 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  24.75 
 
 
643 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  30.3 
 
 
193 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  31.46 
 
 
600 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  25.35 
 
 
185 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.55 
 
 
608 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  27.27 
 
 
184 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  29.7 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  23.3 
 
 
549 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  26.44 
 
 
558 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 
375 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  32.1 
 
 
603 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.21 
 
 
672 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  29.82 
 
 
349 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 
600 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.04 
 
 
612 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>