56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3260 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  100 
 
 		 178 aa  352  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  44.36 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36 
 
 		 158 aa  89  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  32.52 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.69 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.52 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0590  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  32.35 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  23.26 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  27.68 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  31.78 
 
 		 321 aa  51.2  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  26.4 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  26.92 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  35.64 
 
 		 471 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  23.44 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.76 
 
 		 466 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  24.27 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  34.48 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  32.53 
 
 		 131 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  32.53 
 
 		 131 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.87 
 
 		 471 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  26.44 
 
 		 531 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  26.44 
 
 		 534 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.77 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  27.59 
 
 		 576 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  26.32 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  32.58 
 
 		 504 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  35.9 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  27.38 
 
 		 556 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  29.41 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  27.38 
 
 		 531 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.16 
 
 		 471 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  32.63 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  27.38 
 
 		 566 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  34.52 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  29.41 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  27.49 
 
 		 531 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  27.38 
 
 		 531 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.26 
 
 		 287 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  33.8 
 
 		 108 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  33.8 
 
 		 108 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01498  thiol-disulfide isomerase  30 
 
 		 205 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  30 
 
 		 605 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0193  hypothetical protein  31.15 
 
 		 186 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  41.6  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.63 
 
 		 672 aa  41.6  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  42.86 
 
 		 268 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  32.88 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  29.59 
 
 		 116 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  29.33 
 
 		 229 aa  41.2  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  31.52 
 
 		 110 aa  41.2  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  28.09 
 
 		 108 aa  40.8  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  35.29 
 
 		 98 aa  41.2  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  34 
 
 		 107 aa  40.8  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>