28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8830 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  32 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  39.62 
 
 		 218 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.25 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.57 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  33.65 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  31.48 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  28.12 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  28.35 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  28.35 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01498  thiol-disulfide isomerase  29.79 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  25.19 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0193  hypothetical protein  33.04 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  30.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 602 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  29.41 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.11 
 
 		 609 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  35.48 
 
 		 705 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  29.13 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  27.37 
 
 		 590 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.96 
 
 		 611 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  33.7 
 
 		 643 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  34.04 
 
 		 692 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  30.3 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.19 
 
 		 610 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0590  hypothetical protein  33.75 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578551 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  29.35 
 
 		 552 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>