23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4409 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  448  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  41.79 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  47.15 
 
 
204 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  45.53 
 
 
204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  34.01 
 
 
179 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  41.6 
 
 
165 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  41.09 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  43.12 
 
 
190 aa  92  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  34.59 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  26.42 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.48 
 
 
158 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  30 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  28.18 
 
 
661 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  27.27 
 
 
650 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.58 
 
 
165 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  27.91 
 
 
705 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  23.44 
 
 
178 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  27.97 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  26.12 
 
 
692 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  27.48 
 
 
218 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.04 
 
 
624 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  26.52 
 
 
274 aa  41.6  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  26.26 
 
 
130 aa  41.6  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>