24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0742 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  97.06 
 
 
204 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  48.69 
 
 
199 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  53.48 
 
 
190 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  40.77 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  44.19 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  30.67 
 
 
179 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  39.67 
 
 
165 aa  98.6  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  26.92 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  28.3 
 
 
170 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  25 
 
 
172 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.05 
 
 
421 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  39.66 
 
 
672 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  37.5 
 
 
692 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.25 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  39.22 
 
 
667 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  29.76 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  27.27 
 
 
669 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  37.1 
 
 
737 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  31.08 
 
 
644 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  28.05 
 
 
148 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  36.21 
 
 
641 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  38.89 
 
 
682 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  29.27 
 
 
721 aa  41.6  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>