166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0897 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1342    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1409  protein of unknown function DUF255  41.4 
 
 
581 aa  434  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  39.97 
 
 
686 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  37 
 
 
685 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  34.63 
 
 
690 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  38.28 
 
 
680 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  38.41 
 
 
687 aa  364  3e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  35.77 
 
 
686 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  36.32 
 
 
665 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  38.31 
 
 
673 aa  360  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  31.79 
 
 
681 aa  359  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  35.04 
 
 
678 aa  355  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  35.53 
 
 
699 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  36.73 
 
 
684 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  34.44 
 
 
672 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  34.8 
 
 
673 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  37.56 
 
 
686 aa  349  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  34.7 
 
 
681 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  35.76 
 
 
693 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  35.7 
 
 
634 aa  347  6e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  30.78 
 
 
697 aa  346  8e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  36.27 
 
 
700 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  33.79 
 
 
725 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  34.83 
 
 
696 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  32.59 
 
 
706 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  36.88 
 
 
703 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  37 
 
 
691 aa  337  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  33.48 
 
 
675 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  33.61 
 
 
717 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  30.26 
 
 
679 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  33.84 
 
 
700 aa  330  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  34.91 
 
 
705 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  33.19 
 
 
676 aa  330  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  33.33 
 
 
718 aa  329  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  32.15 
 
 
715 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  34.55 
 
 
666 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  34.1 
 
 
699 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  32.87 
 
 
677 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  38.96 
 
 
687 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  32.85 
 
 
711 aa  326  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  32.97 
 
 
700 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  34.91 
 
 
669 aa  324  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  34.74 
 
 
707 aa  324  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  35.28 
 
 
681 aa  320  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  33.02 
 
 
694 aa  316  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  37.12 
 
 
700 aa  316  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  33.28 
 
 
733 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  33.28 
 
 
680 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  35.03 
 
 
723 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  35.33 
 
 
669 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  33.39 
 
 
662 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  32.47 
 
 
660 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  38.04 
 
 
721 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  34.06 
 
 
746 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  32.6 
 
 
664 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  32.6 
 
 
664 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  32.13 
 
 
641 aa  310  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  30.52 
 
 
722 aa  310  5.9999999999999995e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  31.69 
 
 
665 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  42.36 
 
 
752 aa  309  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  35.43 
 
 
711 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  32.76 
 
 
656 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  35.38 
 
 
671 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  34.38 
 
 
750 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  33.21 
 
 
596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  34.95 
 
 
670 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  32.16 
 
 
667 aa  304  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  33.62 
 
 
706 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  33.95 
 
 
718 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  33.95 
 
 
718 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  31.74 
 
 
664 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  33.14 
 
 
681 aa  301  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  32.63 
 
 
665 aa  300  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  32.85 
 
 
657 aa  300  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  31.3 
 
 
682 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  32.62 
 
 
676 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  32.33 
 
 
658 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  29.69 
 
 
696 aa  297  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  32.57 
 
 
676 aa  298  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  33.08 
 
 
677 aa  297  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  33.63 
 
 
673 aa  297  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  33.03 
 
 
676 aa  296  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  30.73 
 
 
669 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  31.19 
 
 
699 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  32.07 
 
 
715 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  33.12 
 
 
712 aa  295  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  31.34 
 
 
673 aa  294  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  32.18 
 
 
667 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  32.4 
 
 
700 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  30.25 
 
 
744 aa  292  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  33.9 
 
 
615 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  30.47 
 
 
652 aa  291  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  31.38 
 
 
699 aa  291  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 
714 aa  290  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  31.33 
 
 
710 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  30.56 
 
 
720 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  34.46 
 
 
682 aa  287  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  31.91 
 
 
676 aa  286  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  33.4 
 
 
661 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  31.31 
 
 
751 aa  284  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>