155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2477 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  100 
 
 
679 aa  1374    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  51.56 
 
 
673 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  51.58 
 
 
694 aa  677    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  54.13 
 
 
677 aa  667    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  51.09 
 
 
700 aa  677    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  54.08 
 
 
697 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  56.24 
 
 
676 aa  694    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  44.18 
 
 
681 aa  542  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  41.07 
 
 
690 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  46.4 
 
 
685 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  39.68 
 
 
680 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  37.86 
 
 
711 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  38.24 
 
 
675 aa  496  1e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  42.25 
 
 
682 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  39.45 
 
 
699 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  41.74 
 
 
676 aa  485  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  48.38 
 
 
610 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  44.59 
 
 
696 aa  485  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  43.68 
 
 
666 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  37.89 
 
 
686 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  40.78 
 
 
752 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  38.52 
 
 
686 aa  478  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  43.4 
 
 
693 aa  475  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  43.11 
 
 
700 aa  475  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  38.77 
 
 
673 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  46.79 
 
 
593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  41.68 
 
 
681 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  37.16 
 
 
686 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  42.35 
 
 
665 aa  465  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  38.71 
 
 
699 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  42.46 
 
 
676 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  39.18 
 
 
684 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  43.09 
 
 
662 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  42.39 
 
 
678 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  38.26 
 
 
681 aa  452  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  43.98 
 
 
652 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  42.94 
 
 
669 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  42.81 
 
 
658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  40.06 
 
 
733 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  40.78 
 
 
717 aa  443  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  33.9 
 
 
703 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  45.41 
 
 
725 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  39.31 
 
 
721 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  41.9 
 
 
667 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  39.86 
 
 
711 aa  439  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  39.62 
 
 
707 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  41 
 
 
746 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  42.03 
 
 
665 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  37.43 
 
 
671 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  38.23 
 
 
705 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  38.5 
 
 
720 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  33.72 
 
 
687 aa  433  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  37.76 
 
 
680 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  36.62 
 
 
712 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  38.8 
 
 
715 aa  429  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  39.82 
 
 
700 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  34.9 
 
 
691 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  40.03 
 
 
710 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  38.45 
 
 
722 aa  425  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  38.03 
 
 
723 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  39.28 
 
 
660 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  40.15 
 
 
750 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  39.09 
 
 
714 aa  422  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  39.69 
 
 
641 aa  422  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  39.17 
 
 
687 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  38.3 
 
 
751 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  38.05 
 
 
676 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  40.61 
 
 
682 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  36.97 
 
 
706 aa  415  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  40.03 
 
 
672 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  36.51 
 
 
670 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  41.61 
 
 
706 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  42.07 
 
 
677 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  42.57 
 
 
665 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  37.35 
 
 
666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  38.18 
 
 
669 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  37.06 
 
 
666 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  43.28 
 
 
718 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  37.69 
 
 
700 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  32.65 
 
 
681 aa  405  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  38 
 
 
744 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  36.32 
 
 
720 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  36.26 
 
 
737 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  42.9 
 
 
680 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  36.83 
 
 
676 aa  399  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  40.12 
 
 
669 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  37.14 
 
 
711 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  43.51 
 
 
718 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  43.51 
 
 
718 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  42.02 
 
 
657 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  38.46 
 
 
687 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2586  protein of unknown function DUF255  39.36 
 
 
691 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  38.53 
 
 
696 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  39.65 
 
 
673 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  33.75 
 
 
693 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  34.75 
 
 
688 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  41.33 
 
 
682 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  35.3 
 
 
682 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  35.6 
 
 
687 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  38.39 
 
 
699 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>