39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1737 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  335  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  35.85 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  31.01 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  84  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  26.42 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  25.19 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  28.23 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  27.42 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  28.8 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  25.38 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  25.5 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  34.41 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  25 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  23.89 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  31.11 
 
 		 569 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  23.26 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  23.89 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.68 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  34.25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.68 
 
 		 406 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  22.22 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.67 
 
 		 810 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  23.15 
 
 		 536 aa  44.3  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  30.09 
 
 		 558 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.55 
 
 		 606 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  23.08 
 
 		 692 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  27.37 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  30.3 
 
 		 705 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  22.22 
 
 		 661 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  28.74 
 
 		 590 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  25.71 
 
 		 531 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0120  hypothetical protein  25.77 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  24.53 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  35.71 
 
 		 643 aa  41.6  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  30.3 
 
 		 270 aa  40.8  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0590  hypothetical protein  24.14 
 
 		 278 aa  40.8  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578551 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  23.21 
 
 		 650 aa  40.8  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0927  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.119484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  24.74 
 
 		 581 aa  40.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>