69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4583 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  41.52 
 
 
178 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  36.22 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.22 
 
 
154 aa  92.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.09 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  38.74 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.16 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0590  hypothetical protein  34.38 
 
 
278 aa  64.3  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  30.4 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  30.4 
 
 
218 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8830  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.7 
 
 
136 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616779  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  25.98 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  28.8 
 
 
199 aa  54.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01498  thiol-disulfide isomerase  30.1 
 
 
205 aa  54.7  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  32 
 
 
204 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  31 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  33.33 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  35.71 
 
 
108 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  32.05 
 
 
106 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0193  hypothetical protein  35.19 
 
 
186 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  35.29 
 
 
108 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  26.6 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  24.64 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  26.23 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  26.6 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  34.85 
 
 
107 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  37.88 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  36.49 
 
 
108 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.1 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  33.33 
 
 
110 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  32.47 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  29.36 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  32.47 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  27.96 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  31.82 
 
 
110 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  26.73 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
90 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  31.52 
 
 
119 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  30.23 
 
 
133 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  31.82 
 
 
110 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  30.19 
 
 
122 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  32.22 
 
 
108 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  34.18 
 
 
114 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  28.74 
 
 
568 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  32.98 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  30.3 
 
 
110 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  30.3 
 
 
88 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  30.67 
 
 
111 aa  41.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  30.3 
 
 
110 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  36.36 
 
 
110 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  38.24 
 
 
106 aa  41.2  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.49 
 
 
110 aa  41.2  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  26.79 
 
 
447 aa  40.8  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  34.12 
 
 
105 aa  40.8  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  34.85 
 
 
106 aa  40.8  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  34.85 
 
 
112 aa  41.2  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  32.1 
 
 
280 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  30.85 
 
 
112 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  28.33 
 
 
557 aa  40.8  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  30.85 
 
 
112 aa  40.8  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  31.33 
 
 
123 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  34.15 
 
 
104 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>