292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7116 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  36.99 
 
 		 148 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  43.36 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  39.64 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  37.98 
 
 		 466 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  35.2 
 
 		 465 aa  84  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  38.37 
 
 		 391 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  39.62 
 
 		 603 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  29.6 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  33.58 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.04 
 
 		 567 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.04 
 
 		 567 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.96 
 
 		 561 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.71 
 
 		 567 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.71 
 
 		 567 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.68 
 
 		 602 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.44 
 
 		 610 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.44 
 
 		 613 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.44 
 
 		 613 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.71 
 
 		 567 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  35 
 
 		 595 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  35 
 
 		 595 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  29.8 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  35 
 
 		 595 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.63 
 
 		 565 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.14 
 
 		 592 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.56 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  36.56 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.56 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.56 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.56 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.56 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  30.95 
 
 		 625 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.98 
 
 		 613 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  36.56 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.48 
 
 		 565 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.6 
 
 		 610 aa  60.8  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  32.71 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.45 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.89 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.98 
 
 		 619 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.48 
 
 		 583 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  32.08 
 
 		 654 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.62 
 
 		 600 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.41 
 
 		 583 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  25 
 
 		 596 aa  58.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.95 
 
 		 582 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 624 aa  57.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  25.34 
 
 		 326 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.77 
 
 		 607 aa  57.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  27.86 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.98 
 
 		 810 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.7 
 
 		 563 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.03 
 
 		 624 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  27.73 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  30.63 
 
 		 623 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.48 
 
 		 604 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.47 
 
 		 619 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.24 
 
 		 611 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  27.64 
 
 		 618 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  36.36 
 
 		 589 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.55 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.24 
 
 		 631 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  28.35 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.06 
 
 		 619 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.8 
 
 		 609 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  35.56 
 
 		 471 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  26.02 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  32.46 
 
 		 623 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  28.18 
 
 		 552 aa  53.9  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  27.21 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  26.47 
 
 		 631 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  29.17 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.32 
 
 		 604 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  27.4 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  32.91 
 
 		 632 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  31.91 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.59 
 
 		 449 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  28.42 
 
 		 581 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.17 
 
 		 570 aa  52.4  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  31.94 
 
 		 611 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.89 
 
 		 616 aa  52  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.12 
 
 		 570 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.11 
 
 		 466 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.89 
 
 		 616 aa  52  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  29.29 
 
 		 549 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.81 
 
 		 789 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  29.31 
 
 		 649 aa  51.2  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  31.19 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  31.78 
 
 		 586 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  30.71 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  26.47 
 
 		 627 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  26.47 
 
 		 627 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  30.46 
 
 		 586 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.47 
 
 		 627 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  30.71 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  26.19 
 
 		 590 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.47 
 
 		 627 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  27.88 
 
 		 615 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>