201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0388 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 466 aa  969    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  30.56 
 
 		 465 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5686  hypothetical protein  23.58 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  35.46 
 
 		 148 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  41.41 
 
 		 162 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  44.9 
 
 		 157 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5616  hypothetical protein  22.93 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.56234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  37.98 
 
 		 161 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  26.6 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1255  hypothetical protein  24.17 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201355  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  29.23 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4309  hypothetical protein  30.99 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147931  normal  0.0295343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  32.17 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1362  hypothetical protein  29.73 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  30.53 
 
 		 552 aa  63.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  32 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  32 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  32 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  32 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  32 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  32 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  32 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  30.39 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  29.77 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  33.65 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  31.78 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  30.17 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  29 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  26.73 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  32.95 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  31.78 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  29.55 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  27.27 
 
 		 176 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  31.96 
 
 		 667 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  27.68 
 
 		 556 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  30.53 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  27.36 
 
 		 531 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  27.36 
 
 		 531 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  38.3 
 
 		 102 aa  55.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  27.36 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  26.96 
 
 		 176 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  26.52 
 
 		 692 aa  54.7  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  31.11 
 
 		 658 aa  54.3  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.788472 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  31.07 
 
 		 643 aa  53.9  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  28 
 
 		 534 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  31.4 
 
 		 678 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  28 
 
 		 531 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  36.36 
 
 		 241 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.72 
 
 		 606 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  32.04 
 
 		 681 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2855  protein of unknown function DUF255  27.19 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  31.46 
 
 		 839 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  29.51 
 
 		 675 aa  51.6  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 687 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  31.46 
 
 		 682 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  30.83 
 
 		 155 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  28.89 
 
 		 737 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  32.58 
 
 		 700 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  29.21 
 
 		 590 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  31.46 
 
 		 676 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  32.18 
 
 		 676 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  30 
 
 		 641 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  30.68 
 
 		 676 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  28.41 
 
 		 672 aa  50.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 610 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  31.4 
 
 		 682 aa  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  31.4 
 
 		 669 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  31.31 
 
 		 694 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  28.41 
 
 		 705 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  31 
 
 		 682 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  27.84 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  28.28 
 
 		 720 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  29.21 
 
 		 693 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.22 
 
 		 604 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  30 
 
 		 680 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  32.18 
 
 		 752 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  32.53 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3976  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  29.21 
 
 		 685 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  31.07 
 
 		 687 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  30.34 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  34 
 
 		 109 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  27.69 
 
 		 661 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  27.45 
 
 		 650 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  29.21 
 
 		 686 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  30 
 
 		 137 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  31.91 
 
 		 711 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  34.04 
 
 		 110 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  36.78 
 
 		 109 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  29.55 
 
 		 682 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 606 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  29.21 
 
 		 681 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  30.43 
 
 		 693 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  29.55 
 
 		 699 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  29.76 
 
 		 615 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  31.87 
 
 		 697 aa  47.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  29.76 
 
 		 615 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  30.34 
 
 		 696 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  29.55 
 
 		 669 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>