117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04029 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  100 
 
 		 529 aa  1068    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  53.72 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  39.6 
 
 		 576 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  39.82 
 
 		 531 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  39.21 
 
 		 531 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  40.09 
 
 		 534 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  37.22 
 
 		 556 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  38.72 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  38.72 
 
 		 531 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  36.64 
 
 		 522 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  36.64 
 
 		 522 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  36.21 
 
 		 522 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 522 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 522 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 522 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  36.21 
 
 		 522 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2325  putative lipoprotein  36.17 
 
 		 136 aa  67  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  32.95 
 
 		 176 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  29.45 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  29.77 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  29.91 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.21 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.02 
 
 		 810 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.11 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.85 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  25 
 
 		 465 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  28.86 
 
 		 176 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  36 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.11 
 
 		 591 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  31.82 
 
 		 406 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  31.53 
 
 		 471 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  23.9 
 
 		 274 aa  53.9  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  26.26 
 
 		 270 aa  53.5  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  25.86 
 
 		 326 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  33.87 
 
 		 603 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  38.16 
 
 		 150 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  38.16 
 
 		 150 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  32.95 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  38.16 
 
 		 150 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  24.22 
 
 		 536 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  36.9 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  32.69 
 
 		 600 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.43 
 
 		 591 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  27.27 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  31.43 
 
 		 552 aa  51.2  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  32.39 
 
 		 182 aa  50.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.7 
 
 		 604 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  28.28 
 
 		 623 aa  50.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  29.2 
 
 		 586 aa  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  33.05 
 
 		 154 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  23.31 
 
 		 162 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.92 
 
 		 606 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  31.33 
 
 		 140 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3976  hypothetical protein  30.83 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.4 
 
 		 154 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  33.01 
 
 		 133 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  31.63 
 
 		 544 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  32.14 
 
 		 111 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  31.31 
 
 		 98 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  34.38 
 
 		 130 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  30.49 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  29.2 
 
 		 586 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.39 
 
 		 586 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  33.7 
 
 		 134 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  29.41 
 
 		 603 aa  47.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.69 
 
 		 613 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.69 
 
 		 613 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  25.66 
 
 		 629 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 581 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  31.65 
 
 		 589 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.87 
 
 		 613 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.85 
 
 		 619 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.08 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.04 
 
 		 616 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 162 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.91 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  26.79 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.33 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  28.87 
 
 		 127 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  32.5 
 
 		 144 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  31.82 
 
 		 88 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  25.89 
 
 		 569 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.98 
 
 		 204 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.76 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  29.36 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.11 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.4 
 
 		 610 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  30.48 
 
 		 184 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.79 
 
 		 619 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.03 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  32.18 
 
 		 341 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.17 
 
 		 624 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  28.83 
 
 		 623 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  33.73 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  28.93 
 
 		 618 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  29.25 
 
 		 155 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.85 
 
 		 619 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  29.7 
 
 		 165 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>