256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2613 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  100 
 
 		 421 aa  857    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  51.1 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1455  hypothetical protein  29.36 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2614  hypothetical protein  25.85 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  26.47 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  30 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.3 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1940  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.77 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  30.36 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  32.11 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3463  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.08 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0259  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  26.96 
 
 		 167 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.482203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  31.68 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1327  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.92 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.46763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.35 
 
 		 628 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  28.71 
 
 		 569 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  32.98 
 
 		 614 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0459  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.89 
 
 		 266 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.136195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  32.98 
 
 		 617 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.89 
 
 		 789 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2255  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.47 
 
 		 152 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  31.91 
 
 		 615 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.36 
 
 		 592 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  31.91 
 
 		 615 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  32.98 
 
 		 611 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.08 
 
 		 810 aa  53.5  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.14 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.98 
 
 		 627 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.25 
 
 		 609 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  30.21 
 
 		 618 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  30 
 
 		 623 aa  53.1  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  31.91 
 
 		 611 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  31.91 
 
 		 615 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.14 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  29.47 
 
 		 705 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  29.17 
 
 		 626 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.46 
 
 		 610 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.09 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.78 
 
 		 631 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0400  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.78 
 
 		 150 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.569021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.55 
 
 		 176 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  29.17 
 
 		 631 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0305  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  43.4 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0383  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  29.08 
 
 		 142 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.31 
 
 		 611 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  35 
 
 		 188 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0437  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.78 
 
 		 150 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  24.19 
 
 		 178 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  32 
 
 		 583 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 613 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.93 
 
 		 602 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  31.91 
 
 		 145 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 		 565 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  25.53 
 
 		 536 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1483  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.7 
 
 		 150 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.364042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.91 
 
 		 627 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.91 
 
 		 627 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.91 
 
 		 627 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  32.98 
 
 		 648 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.91 
 
 		 627 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.91 
 
 		 627 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 613 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  30.63 
 
 		 756 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 		 565 aa  50.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.91 
 
 		 627 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  30.56 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  26.92 
 
 		 165 aa  50.4  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 619 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21640  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.53 
 
 		 142 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  30.56 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 619 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 613 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0574  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.56 
 
 		 269 aa  50.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  31 
 
 		 583 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  32.56 
 
 		 140 aa  50.1  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.63 
 
 		 563 aa  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  29.79 
 
 		 697 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.56 
 
 		 565 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2249  peptidylprolyl isomerase  33 
 
 		 254 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00467929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.03 
 
 		 567 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.03 
 
 		 567 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1941  peptidylprolyl isomerase  39.13 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  31.52 
 
 		 142 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  28.72 
 
 		 692 aa  49.7  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  26.55 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.17 
 
 		 567 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.58 
 
 		 627 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42728  predicted protein  26.62 
 
 		 180 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.640933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  27.83 
 
 		 140 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  27.37 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.17 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.04 
 
 		 624 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2256  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  31.37 
 
 		 181 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.638444  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3380  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  23.32 
 
 		 156 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.7 
 
 		 150 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.899429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 604 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>