More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2038 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 357 aa  744    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  36.11 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  28.57 
 
 		 552 aa  67  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.56 
 
 		 449 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  30 
 
 		 581 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  33.06 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  33.33 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  35 
 
 		 98 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2082  hypothetical protein  35.29 
 
 		 932 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.602266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  26.79 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  40.51 
 
 		 768 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  36.36 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  27.52 
 
 		 155 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  36.26 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  28.66 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  33.33 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  29.7 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  36.59 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  34.83 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  26.09 
 
 		 133 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  35.21 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.36 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  38.57 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  40.54 
 
 		 105 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  23.58 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  34.07 
 
 		 90 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  37.04 
 
 		 105 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  42.67 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.78 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  40.54 
 
 		 105 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  37.78 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  31.82 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  38.89 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  32.67 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  29.81 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.26 
 
 		 471 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  50 
 
 		 119 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  36.14 
 
 		 108 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.87 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.57 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  38.89 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  42.31 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  27.66 
 
 		 590 aa  56.6  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  30.21 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  30.1 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  30 
 
 		 600 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  34.95 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  37.93 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  33.77 
 
 		 107 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6562  hypothetical protein  33.02 
 
 		 176 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  37.68 
 
 		 104 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  43.04 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  36.49 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  30.11 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  35.44 
 
 		 146 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  20.41 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  37.04 
 
 		 106 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  37.84 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.21 
 
 		 608 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  35.06 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  28.45 
 
 		 531 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  38.89 
 
 		 119 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  41.1 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  41.1 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  31.31 
 
 		 603 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  37.1 
 
 		 705 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  36.36 
 
 		 109 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  28.83 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  32.63 
 
 		 148 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  27.84 
 
 		 643 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  35.06 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  37.68 
 
 		 108 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  36 
 
 		 107 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.99 
 
 		 673 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  37.14 
 
 		 107 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  35 
 
 		 98 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  37.88 
 
 		 108 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  37.68 
 
 		 120 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  30.1 
 
 		 692 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.03 
 
 		 810 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  41.67 
 
 		 147 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  39.39 
 
 		 110 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  31.96 
 
 		 574 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  35.8 
 
 		 106 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  27.78 
 
 		 536 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  41.67 
 
 		 272 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  35.29 
 
 		 108 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.33 
 
 		 148 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  35.8 
 
 		 106 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  32.58 
 
 		 165 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  34.52 
 
 		 115 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  32.1 
 
 		 119 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  34.67 
 
 		 105 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  30.93 
 
 		 650 aa  53.5  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  37.29 
 
 		 125 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  40.79 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>