283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1636 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  39.02 
 
 		 357 aa  71.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  28.03 
 
 		 544 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  27.73 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  25 
 
 		 531 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  32.98 
 
 		 326 aa  65.1  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  31.82 
 
 		 471 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  28.74 
 
 		 590 aa  62.8  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  32.71 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  25.86 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  26.15 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 643 aa  59.3  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  30 
 
 		 563 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.3 
 
 		 471 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2855  protein of unknown function DUF255  28.41 
 
 		 562 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.3 
 
 		 471 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  29.45 
 
 		 529 aa  58.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  24.81 
 
 		 596 aa  57.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.45 
 
 		 466 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  23.68 
 
 		 581 aa  57.8  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  31.65 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  28.41 
 
 		 549 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  27.06 
 
 		 552 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  30 
 
 		 567 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  30 
 
 		 567 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  30 
 
 		 567 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.39 
 
 		 567 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  31.94 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.39 
 
 		 567 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  30.26 
 
 		 692 aa  55.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.28 
 
 		 611 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  29.91 
 
 		 648 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.3 
 
 		 565 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  32 
 
 		 609 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  25 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  28.24 
 
 		 586 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.67 
 
 		 600 aa  55.1  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  24.18 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.03 
 
 		 449 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.46 
 
 		 596 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  26.96 
 
 		 466 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.37 
 
 		 595 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  30.48 
 
 		 577 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.3 
 
 		 602 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.37 
 
 		 595 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.37 
 
 		 595 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  34.78 
 
 		 603 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  29.91 
 
 		 645 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  27.47 
 
 		 623 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.69 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  30.69 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  28.33 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  36.76 
 
 		 586 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.69 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.3 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.3 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.11 
 
 		 602 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  30.69 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.69 
 
 		 591 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.41 
 
 		 561 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  23.28 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  25.44 
 
 		 536 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.3 
 
 		 565 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.3 
 
 		 565 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.81 
 
 		 624 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  24.73 
 
 		 661 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  29.17 
 
 		 556 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  27.36 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  32 
 
 		 534 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  30.36 
 
 		 531 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 591 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.58 
 
 		 635 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  33.33 
 
 		 649 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.63 
 
 		 570 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.95 
 
 		 581 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  21.85 
 
 		 274 aa  51.6  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  31 
 
 		 522 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 		 603 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  31.34 
 
 		 705 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  31 
 
 		 522 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  31 
 
 		 522 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 		 810 aa  51.2  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  26.09 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  31 
 
 		 522 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  31 
 
 		 522 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  31 
 
 		 522 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  31 
 
 		 522 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  29.46 
 
 		 576 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.35 
 
 		 592 aa  50.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.21 
 
 		 589 aa  50.8  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  23.26 
 
 		 611 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  32.99 
 
 		 750 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  26.36 
 
 		 611 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 531 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  22.32 
 
 		 391 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 531 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.59 
 
 		 607 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2338  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.68 
 
 		 609 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.33 
 
 		 590 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>