96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7011 on replicon NC_013733
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 326 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  33.06 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  27.36 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  23.91 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  32.98 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  29.46 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  27.36 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  27.05 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  28.04 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  25.34 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  28.3 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  34.62 
 
 		 581 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  27.36 
 
 		 600 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.26 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  30.7 
 
 		 517 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  31.25 
 
 		 104 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  31.78 
 
 		 471 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.47 
 
 		 602 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  29.81 
 
 		 577 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  31.87 
 
 		 133 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  33.33 
 
 		 590 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  39.68 
 
 		 650 aa  53.5  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  25.86 
 
 		 529 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 570 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  29.55 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  35.38 
 
 		 661 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.36 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.72 
 
 		 596 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  32.86 
 
 		 692 aa  49.7  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  27.47 
 
 		 611 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  26.79 
 
 		 571 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  25.47 
 
 		 504 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  26.79 
 
 		 571 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  30.11 
 
 		 102 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  29.73 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  24.3 
 
 		 569 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  34.78 
 
 		 705 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  31.43 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  27.45 
 
 		 571 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  28.42 
 
 		 589 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  24.74 
 
 		 466 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  24.17 
 
 		 167 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  32.89 
 
 		 108 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0259  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.89 
 
 		 743 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  27.37 
 
 		 589 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43384  predicted protein  29 
 
 		 164 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  27.78 
 
 		 145 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.07 
 
 		 605 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  26.92 
 
 		 146 aa  46.2  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  26.51 
 
 		 449 aa  45.8  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  26.8 
 
 		 536 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  30.91 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  33.33 
 
 		 113 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.47 
 
 		 608 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  29.03 
 
 		 768 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  24.81 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.14 
 
 		 745 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3249  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  26.9 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0805805  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  33.77 
 
 		 129 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  36.11 
 
 		 105 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  26.58 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.74 
 
 		 563 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  31.4 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.71 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  38.36 
 
 		 101 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  32.31 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  26.03 
 
 		 179 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  35.85 
 
 		 671 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  29.55 
 
 		 558 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  25.25 
 
 		 149 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  29.09 
 
 		 643 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  36.62 
 
 		 133 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 576 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  37.74 
 
 		 686 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  27.88 
 
 		 147 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  29.91 
 
 		 133 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.76 
 
 		 466 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  24.49 
 
 		 589 aa  42.7  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  24.32 
 
 		 155 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  25.3 
 
 		 449 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 531 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 531 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 566 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.73 
 
 		 654 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  30.99 
 
 		 672 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  34.29 
 
 		 193 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  27.91 
 
 		 182 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  33.77 
 
 		 112 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.427267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>