294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2338 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2338  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 609 aa  1197    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.21 
 
 		 614 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.9 
 
 		 789 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  38.24 
 
 		 750 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.75 
 
 		 810 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.42 
 
 		 613 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.33 
 
 		 586 aa  362  8e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  34.79 
 
 		 731 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  40.72 
 
 		 642 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  37.54 
 
 		 623 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  38.42 
 
 		 608 aa  342  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.3 
 
 		 608 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  35.69 
 
 		 630 aa  338  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  35.86 
 
 		 654 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  39.8 
 
 		 649 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.44 
 
 		 626 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.4 
 
 		 624 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.6 
 
 		 654 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  39.6 
 
 		 623 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.62 
 
 		 616 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.62 
 
 		 616 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.61 
 
 		 752 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.53 
 
 		 628 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.17 
 
 		 611 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  37.39 
 
 		 605 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.57 
 
 		 589 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  36.89 
 
 		 610 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  31.67 
 
 		 586 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.4 
 
 		 624 aa  317  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  31.38 
 
 		 586 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.49 
 
 		 567 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.37 
 
 		 600 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.49 
 
 		 567 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.49 
 
 		 567 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  35.32 
 
 		 603 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  36 
 
 		 563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.31 
 
 		 567 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.31 
 
 		 567 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  34.72 
 
 		 622 aa  309  8e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.14 
 
 		 631 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  36.12 
 
 		 604 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.76 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  35.19 
 
 		 629 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.43 
 
 		 565 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.43 
 
 		 565 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.26 
 
 		 565 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.43 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  34.43 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  37.08 
 
 		 577 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.67 
 
 		 565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.84 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.26 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.43 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  38.49 
 
 		 745 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.15 
 
 		 616 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  34.26 
 
 		 565 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.6 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.25 
 
 		 602 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.76 
 
 		 609 aa  300  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  35.71 
 
 		 623 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.35 
 
 		 628 aa  300  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.73 
 
 		 604 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.86 
 
 		 561 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.68 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.54 
 
 		 610 aa  296  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.74 
 
 		 590 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  35.35 
 
 		 625 aa  296  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.62 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.06 
 
 		 592 aa  293  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  34.67 
 
 		 618 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.57 
 
 		 592 aa  293  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.47 
 
 		 590 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.39 
 
 		 613 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.55 
 
 		 613 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  34.6 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.42 
 
 		 605 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  35.26 
 
 		 611 aa  290  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.77 
 
 		 613 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  35.88 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.72 
 
 		 624 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.4 
 
 		 619 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.33 
 
 		 604 aa  287  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  34.55 
 
 		 626 aa  286  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.23 
 
 		 619 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.17 
 
 		 619 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.23 
 
 		 619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  34.52 
 
 		 615 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  34.52 
 
 		 615 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.1 
 
 		 595 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.1 
 
 		 595 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.1 
 
 		 595 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.03 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.97 
 
 		 583 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  35.13 
 
 		 617 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.45 
 
 		 583 aa  283  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.16 
 
 		 593 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  32.1 
 
 		 632 aa  283  9e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.65 
 
 		 624 aa  283  9e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  34.34 
 
 		 589 aa  282  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  34.57 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>