More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1855 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  100 
 
 
172 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  31.67 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  29.09 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  30.98 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  27.22 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  29.71 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  32.14 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  31.82 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  27.27 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  28.12 
 
 
149 aa  67  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  25.58 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  28.57 
 
 
517 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  25.38 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  28.93 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0428  hypothetical protein  25.44 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  23.74 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  27.66 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  23.35 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  25.36 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  29.71 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  33.79 
 
 
692 aa  62  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  28.68 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  28.08 
 
 
534 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  26.24 
 
 
196 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  29.45 
 
 
529 aa  61.6  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  21.8 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
576 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  31.78 
 
 
466 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  27.86 
 
 
531 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  25.93 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.43 
 
 
466 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  33.63 
 
 
705 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  29.38 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  25.99 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  29.75 
 
 
688 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  29.75 
 
 
688 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  28.36 
 
 
661 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.97 
 
 
602 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  26.12 
 
 
643 aa  57.8  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  29.5 
 
 
556 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  29.5 
 
 
531 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  30.65 
 
 
603 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  27.41 
 
 
566 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  29.5 
 
 
531 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.95 
 
 
631 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  28.12 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  26.24 
 
 
687 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  31.11 
 
 
657 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  26.55 
 
 
650 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  29.58 
 
 
700 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.28 
 
 
592 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  28.21 
 
 
569 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  29.31 
 
 
603 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  27.74 
 
 
671 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  26.67 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  29.46 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  30 
 
 
677 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
522 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  27.32 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  29.79 
 
 
544 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  22.96 
 
 
349 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  27.5 
 
 
522 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  27.5 
 
 
522 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  27.5 
 
 
522 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  27.5 
 
 
522 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  27.5 
 
 
522 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  27.5 
 
 
522 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  30.15 
 
 
696 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.43 
 
 
449 aa  54.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  31.82 
 
 
658 aa  54.7  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  28.7 
 
 
465 aa  54.7  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  30.43 
 
 
471 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  28.33 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.39 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  30.33 
 
 
600 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  27.4 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  26.72 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.52 
 
 
614 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  34.55 
 
 
504 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  31.5 
 
 
699 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  25.58 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  29.25 
 
 
589 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  22.58 
 
 
199 aa  52.4  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  27.7 
 
 
681 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  21.74 
 
 
191 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  32.76 
 
 
608 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 
583 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  22.03 
 
 
270 aa  51.6  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  31.71 
 
 
839 aa  51.2  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  34.38 
 
 
218 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.17 
 
 
583 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  27.97 
 
 
676 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.61 
 
 
612 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  30.53 
 
 
665 aa  50.8  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  28.23 
 
 
682 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.35 
 
 
192 aa  50.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  27.87 
 
 
711 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  28.07 
 
 
596 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>